指纹门禁系统的安全措施主要包括以下几个方面：

一、物理安全保障措施

指纹采集设备的保护：确保指纹设备受到适当的物理保护，防止被他人拆解或恶意操作。这可以通过安装在固定位置、设有防盗报警和监控系统等措施来实现。

提高指纹传输的安全性：指纹信息在传输过程中需要采取加密技术、虚拟专线等安全措施，确保传输的机密性和完整性，避免被黑客截取或篡改。

强化后台服务器的物理安全：后台服务器存储着大量的用户指纹信息，因此服务器的物理安全至关重要。应采取严格的进出控制、视频监控、防火墙等措施来防止服务器被非法入侵和物理破坏。

二、技术安全保障措施

改进指纹识别算法：提高算法的准确性和鲁棒性对识别系统的安全性至关重要。通过不断研发和优化算法，可以提高指纹识别的准确度和降低虚假率，从而防止被伪造指纹所攻击。

防止指纹复制：为了防止指纹被复制，可以采取多重验证技术，如脉冲电流感应、3D指纹检测等，提高系统的抗伪造能力。

强化用户隐私保护：指纹识别系统涉及用户隐私信息，必须保证用户信息的安全和隐私。应采取数据加密、数据权限分级、匿名化处理等措施，确保用户数据的保密性和合法性。

三、管理安全保障措施

设立有效的使用权限管理系统：为了确保指纹识别系统的合法使用，可以建立一个严格的使用权限管理系统。对于不同级别和职务的人员，分配不同的权限和访问控制策略，确保只有授权人员才能使用指纹识别设备。

定期进行系统安全检查：定期对指纹识别系统进行安全检查和风险评估，及时发现和修复潜在的安全漏洞。这可以借助安全专家的帮助来实现。

此外，智能门锁还具备以下安全措施：

防小黑盒干扰：智能锁内部加装电磁屏蔽装置，防止特斯拉线圈（俗称小黑盒）产生的巨大磁场干扰智能锁主板，导致指纹锁被“秒开”。

实用性报警功能：智能锁具备防撬告警、试开告警、虚掩告警、低电压告警等功能，可发出告警声震慑不法分子，并可通过联网功能将报警信息实时传送给手机提醒。

信息加密存储：智能锁会将用户数据储存在安全芯片中，确保用户信息安全，并且可以自动拒绝任何没有授权的访问。

半导体指纹头：采用半导体指纹传感器，非活体的、复制的指纹无法打开门锁，提高了指纹识别的精准度和安全性。

C级锁芯：智能锁常用的C级锁芯具有最高的安全系数，理论上技术开锁时长超过270分钟，能有效避免小偷等不法分子的窥探。

综上所述，指纹门禁系统的安全措施涉及物理安全、技术安全和管理安全等多个方面，旨在确保系统的稳定运行和用户信息的安全。